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原创 生信宝典:生物信息学习系列教程、视频、资源

欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需...

2018-01-31 10:02:40 10592 3

转载 北京大学临床医学高等研究院陈扬课题组博士后招聘启事

如国家资助博士后研究人员计划,香江学者计划、澳门青年学者计划、国际交流计划学术交流项目和医学部博雅博士后等项目,以及国家自然科学基金、北京市自然科学基金、中国博士后科学基金等。2024年9月21日上午,2025届全国普通高校毕业生就业促进周双选活动将在提子科技大学思群广场举行。2024年9月21日上午,2025届全国普通高校毕业生就业促进周双选活动将在提子科技大学思群广场举行。2024年9月21日上午,2025届全国普通高校毕业生就业促进周双选活动将在提子科技大学思群广场举行。

2025-06-24 21:02:35 2

转载 学科前沿 | 北京大学叶敏团队与合作者在植物芹糖基转移酶研究中取得新进展

将其与在欧芹中挖掘得到的PcApiGT和甘草GuApiGT比较分析,利用获得的1套PcApiGT/UDP和2套PcApiGT/UDP/糖受体复合物结构,结合理论计算与定点突变实验,阐明了CaApiGT为代表的黄酮3-O-糖苷芹糖基转移酶与GuApiGT/PcApiGT为代表的黄酮7/4′-O-糖苷芹糖基转移酶的糖受体选择性机制,发现了蛋白活性口袋中一个关键α-helix发挥的重要作用。如有侵犯作者著作权,请及时与我们联系(Tel:025-83271227,或直接在微信平台留言),我们将及时更正或删除。

2025-06-24 21:02:35 2

转载 连载 | 基因组如何进化?(5) 基因共线性

注意,虽然匹配的索引序列 (红色标记)的顺序相同,但小鼠谱系中的DNA。在随后的反应中,单链DNA拷贝的进一步处理导致L1元件的新双链DNA拷贝的产生,该拷贝插入到初始切口的位置。这种类型的净损失,在所有这些区域都是典型的,其解释了小鼠基因组中的DNA比人类基因组少14%的事实。因此,我们的基因组大小,被认为与人类和小鼠的最后一个共同祖先的基因组大小几乎没有变化,而小鼠的基因组只小了约。靶DNA时,L1元件 (红色)的转位开始。正如预期的那样,人类与黑猩猩的基因组比人类与小鼠的基因组更相似,尽管这三个。

2025-06-23 21:01:32 14

转载 Nature专访饶毅教授:中国如何能够成为生物科技超级大国?团结起来共享数据

1980 年代,饶毅在美国开启职业生涯,2007 年,他辞去美国西北大学终身教职,全职回国,出任北京大学生命科学学院院长,他引入了多项举措,使中国生命科学研究重焕生机,其中包括采用终身教职制度和同行评审来评估学者的学术成就。例如,1950 年,中华人民共和国刚刚成立,具有国际教育背景的中国博士学者还很少,从中国科学院到北京大学和清华大学,许多担任科学和教育领导职务的人都在国外获得了博士学位。中国在精准医疗方面落后于美国,因为中国在人类遗传学研究方面较为薄弱,而在意义不大的 DNA 测序方面却过于泛滥。

2025-06-23 21:01:32 50

转载 连载 | 基因组如何进化?(6) 基因组大小与重复序列

蛋白的人类和河豚基因的基因组序列比较。这两个基因 (红线)都包含67个短外显子,它们以 1:1 的对应关系排列;虽然最初是一个谜,但我们现在对较类似生物体之间基因组大小的巨大差异有了一个简单的解释:因为所有脊椎动物都经历了。的脊椎动物中,基因组大小可能会有很大差异,但显然对生物体或其基因的数量无显著影响。在很长一段时间内,这会导致从这种鱼类基因组中,),又名河豚、艇巴,鲀形目-鲀科-东方鲀,属硬骨鱼。在大多数研究良好的脊椎动物的基因组中,占据了很大一部分。,产于黄海、渤海和东海,北太平洋西部,为暖水性。

2025-06-22 21:01:38 9

转载 iMeta期刊2024影响因子再创新高(全球Top 0.3%,全国第5)

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,2025年6月获影响因子33.2,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2025-06-21 21:00:57 165

转载 国自然基金委:下一步,在青年科学基金A类中为35岁以下科研人员单设赛道!

然而,科学基金团队类项目的资助强度高,存在一定程度的“论资排辈”现象,与“大牛”领衔的大团队相比,优秀的青年团队难有机会获得资助。“这项技术是全球竞争的制高点,我们的相关发现实现了世界首次”“希望用 5 到 10 年弄通原理,10 到 15 年实现产业化应用”“此前我们已形成良好的交叉合作研究基础,将以各自所长继续服务于这一课题”……,打破以往“台阶式”的人才成长路径,及早发现有潜力的优秀青年人才,给予最长 20 年的高强度稳定支持,使其能够“十年磨一剑”开展高水平基础研究。有没有证据支持你们的学术假说?

2025-06-21 21:00:57 101

转载 连载 | 基因组如何进化?(7) 推断古基因组序列

此外,在5个位置中,只有1个位置的核苷酸差异会导致编码氨基酸的差异 (V>M)。因此,可以合理地假设,现代马蹄蟹的基因组在保留对功能至关重要的特征的同时,一定与 (我们仅通过化石记录所知的)其已灭绝的祖先的基因组,有很大不同。中重建出来,揭示了我们人类的祖先与欧洲的尼安德特人杂交,且现代人从他们那里继承了特定的基因 (下图。进化与自然的选择,必然保持了马蹄蟹基因组的关键功能特性,以导致其谱系在形态上的稳定性。亿年前的共同祖先的大部分基因组序列,此祖先即为狗、鼠、兔、犰狳和人类等如此多样化物种的前体 (

2025-06-19 21:02:13 16

转载 iMeta  近3年植物类文章合集(25.06更新)

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于15的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!iMeta 近3年植物类文章合集(25.06更新)

2025-06-18 21:02:33 64

转载 hLife | 一滴指尖血,打造快速便捷的免疫检测新模式

论文共同通讯作者、深圳先进院研究员杨慧表示,“未来我们将结合蛋白探针的理性设计、人工智能分类算法等新兴技术,持续提升平台的通用性、检测灵敏度和信息解析能力,推动其发展为传染病防控体系的核心技术单元(图5)。研究团队正在进一步开发高稳定性的样本保存方案和适应基层环境的简化操作流程,将结合蛋白探针的理性设计、人工智能分类算法等新兴技术,持续提升平台的通用性、检测灵敏度和信息解析能力,推动其发展为传染病防控体系的核心技术单元。”谭骁天表示,“相比需要数天周期的传统方法,该平台显著提升了检测速度与效率(图4)。

2025-06-17 21:02:49 74

转载 iMeta | 南农土壤生态实验室-解析噬菌体介导的全球沙门氏菌毒力基因传播

点击蓝字 关注我们全球病毒组介导沙门氏菌毒力基因传播和宿主反馈机制iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70042● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70042● 2025年5月20日,南京农业大学孙明明和加泰罗尼亚水研究所Jose Luis Balcazar等在iMeta在线发表了题

2025-06-16 21:01:36 62

转载 文献速递 | Cell 2025.5.29 面向临床医生的微生物组研究;疾病相关蛋白质组;拟南芥单细胞

Cell》为半月刊,由美国细胞出版社发行,聚焦分子生物学、细胞生物学等微观领域的原创性研究;其以深度挖掘生命科学机制见长,论文多涉及基因调控、信号通路等微观层面的突破。通过UKBB、Finngen或GNPC等大规模研究或小型研究产生的血浆蛋白质组,可以使用本研究中提出的新方法进行分析,以确定。蛋白质组学研究的进展加深了我们对疾病生物学的理解。,这些蛋白质以后可用于鉴定新的生物标志物,以及复杂特征和疾病的原因及药物靶点。,并为在不同疾病的血浆蛋白质组学中更广泛的应用铺平道路。

2025-06-16 21:01:36 23

转载 iMetaOmics期刊 第2卷第2期 在线正式发布

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!以深邃的宇宙为背景,主视觉中一轮日食悬于天际,外围炽热的日冕光晕与暗影交织,象征高海拔地区强烈的紫外线对皮肤菌群的塑造与挑战。两人指尖微距间的悬停状态,隐喻微生物的研究与开发利用仍处于一片蓝海。原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70022。

2025-06-15 21:00:48 65

转载 hLife | VarEPS-MPXV: 猴痘病毒变异预警系统助力精准防控

系统通过整合基因组学、结构生物学、环境与社会因素,实现了对已观测变异和潜在虚拟变异的双重预警,为猴痘疫情的精准防控提供科学工具,为全球公共卫生决策提供了多维数据支撑(图2)。该系统不仅支持在线检索、数据下载与交互式可视化,还提供基于变异位点的在线分析工具,包括变异识别、时空追踪、多维度评估、环境及社会因素注释,助力研究人员快速锁定高风险变异,为早期干预与疫苗策略优化提供关键依据。未来,随着数据的持续积累与方法的迭代优化,这一平台或可进一步深化对病毒演化规律的理解,并为公共卫生决策提供更具前瞻性的支持。

2025-06-14 21:01:48 46

转载 iMeta期刊 第4卷第3期 在线正式发布

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!六一儿童节的欢快脚步渐近,膳食纤维、益生菌、益生元、合生元与后生元悄然集结,宛若无形的"微生态哨兵",编织成一面透明的防护盾,借短链脂肪酸的魔法星尘,为肠道镀上天然守护光,将牛奶、鸡蛋等九大食物过敏原悄然阻隔。所有过敏的忧虑都消融在精灵们编织的梦幻气泡里,孩童的笑声在阳光下恣意绽放。

2025-06-13 21:02:09 71

转载 Nature 5.22~29 | CAR-T可能损害大脑;通用科学AI;丹尼索瓦人之谜;CRISPR人体试验

Nature》为周刊,隶属于英国自然出版集团,涵盖自然科学全领域,并设有专门的生命科学板块;关于定居东亚并在今天的人们身上留下遗传遗产的"幽灵氏族"的线索,正在出现。联合国海洋会议,为各国提供修正海洋健康发展路径的契机。上的人们从丹尼索瓦人那里继承了4~6%的遗传物质。美国人才外流:《自然》指南:吸引科学家出国的举措。接受CAR-T细胞治疗的人的大脑显示出炎症迹象。中发现,与东亚各地的化石发现有关。与人类复杂特征相关的细胞的空间 (分辨)映射。最早羊膜动物足迹重新校准四足动物演化时间线。

2025-06-13 21:02:09 53

转载 Cell Research 一作冯桂海专访 | 不以短期的文章产出为目标

我们在构建模型时候考虑,现代生命科学发展了近百年的时间,产生的诸如基因家族定义、启动子区等信息,一定是对模型是有帮助的,而加入哪些知识、如何加入是我们需要人为干预的,在这个选择的过程中,我们通过与生命科学领域专家深入交流,最后选定了加入的知识及加入方式,尤其通过。1)训练数据模态,除了单细胞转录组数据,空间转录组、单细胞表观组甚至文献信息等数据也包含了丰富信息,因此,在未来的 GeneCompass 版本,除了训练数据数据量的提升,我们也计划增加数据模态的多样性,使得模型具有更大的应用范围。

2025-06-11 21:02:40 63

转载 NC | 中科院植物所在木兰类植物比较基因组学研究及苄基异喹啉生物碱的起源演化方面取得新进展

这类天然化合物主要分布于防己科、罂粟科等基部真双子叶及木兰类植物,具抗炎、镇痛、免疫调节、抗肿瘤和抗病毒等多种活性,在传统医药和现代药物研发领域均具有重要应用价值。)事件进化历史,首次推测了木兰类植物的祖先染色体核型,并进一步阐明了染色体结构和重排的历史。),开展了系统的比较基因组学分析,揭示了木兰类植物在进化过程中的全基因组加倍(,但只有基部真双子叶植物和木兰类植物通过选择性保留这些重复基因而维持了。的生物合成途径已有了较为全面的认识,但木兰类植物中。合成途径的起源和演化历史。点击图片直达文字对应教程。

2025-06-11 21:02:40 47

转载 快讯 | 基因表达也论“出身”和“长相”?中山大学骆观正课题组新文章揭示RNA修饰调控等位基因表达的新机制

尤为引人注目的是,在已知的印记基因中发现了m6A修饰的亲源效应。课题组与中科院动物研究所的李伟研究员、周琪院士团队合作完成的“孤雄小鼠”(仅有父源遗传物质的小鼠),正是通过对关键印记基因进行精准的编辑修正,才突破了哺乳动物单性生殖的屏障(详情见:https://doi.org/10.1016/j.stem.2025.01.005)。正如印记基因的表达受到亲源的严格控制,那么,在更广泛的基因中,那些来自父母双方的、序列可能存在细微差异的等位基因,它们的表达又是如何被精确调控的呢?也可能受到更为复杂的。

2025-06-10 21:01:47 42

转载 第六届全国表观遗传信息学大会(第二轮通知)

毕雪华、陈加余、陈盛泉、陈兴、陈颖丽、程郢、邓伍兰、冯会娟、冯智星、郭帆、郭向前、郭振兴、韩俊伟、韩涟漪、胡秀珍、黄恺、姜宁、蒋岚、靳文菲、赖洪燕、李富义、李茹姣、李笑雨、刘国庆、刘嘉琦、刘君、刘赟、吕昊、罗翔宇、马丽佳、孟佳、宁琳、乔云波、秦玉芳、邱育珊、任间、邵振、盛欣、沈一飞、史偈君、孙宝发、孙晓波、王先龙、魏刚、文波、吴旭东、向云龙、谢芃、邢永强、熊旭深、徐锦、宣成昊、严海丹、严健、颜光玗、杨磊、杨旸、杨扬、叶远浓、张春龙、张帆、张俊鹏、张乃千、张绍军、张伟伟、张杨、赵宏宇、郑辉、周猛、邹欣。

2025-06-09 21:01:59 83

转载 iMeta高被引论文,新网址 | 最全可视化韦恩图和集合图工具EVenn使用手册

点击蓝字 关注我们最全可视化集合工具EVenn使用手册iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊:iMeta(IF 23.8)● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.184● 2024年4月11日,中国中医科学院陈同、黄璐琦和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队在iMeta在线联合发表了题为 “Visualizing set relationships: EVenn's comprehensive approach to Venn

2025-06-07 21:01:46 86

转载 连载 | 基因组如何进化?(8) 非编码保守DNA

该领域最引人注目的发现可能来自于观察到的 (在哺乳动物进化过程中)大量不编码蛋白的DNA序列被保存了下来 (下表4-1)。许多不编码蛋白的保守序列现已知会产生非翻译的RNA分子,例如数千种长非编码RNA (lncRNA),它们被认为在调节基因转录方面具有重要作用。严格的保守性意味着,即使序列不编码蛋白质,但每个序列都有一个重要的功能,即通过纯化选择来维持。此例中,所示的每种生物体的基因组序列都与人类CFTR基因 (囊性纤维化跨膜电导调节因子)的指定区域进行了比较,包含了。其中最神秘的,是所谓的“

2025-06-06 21:02:48 67

转载 中山大学骆观正课题组在《Nature Communications》发文报道单分子表观转录组 m6A研究进展

纳米孔直接RNA测序为在单分子水平研究表观转录组提供了革命性的机遇,然而此前的计算工具未能有效地实现单分子m6A检测(本研究提出了多示例回归(MIR)算法,实现了高效利用基于NGS的绝对定量的m6A检测方法给出的位点甲基化率标签,训练了从DRS数据中在单分子水平预测m6A的工具——SingleMod。本研究开发了基于纳米孔直接RNA测序(DRS)的高精度m6A单分子检测工具SingleMod,并首次系统描绘了多个人类细胞系及远缘物种的m6A单分子图谱,揭示了一系列前所未知的m6A基因组学特征与进化规律。

2025-06-04 21:03:39 483

转载 盘点生信常用文件格式的坐标系统:0-based和1-based及实战代码

这两种坐标系统虽然看起来差别不大,但是对于基因组的单碱基变异(SNP)来说,差一个数字所表示的SNP将完全不同,所以区分清楚软件接收或输出的文件的坐标是0-based和1-based非常重要!生物信息学有很多特定的文件格式,比如BED,SAM,VCF等,这些文件可以存储DNA序列的相关信息,也就需要存储对应的碱基坐标,因此衍生出了两种坐标系统:0-based和1-based。:将坐标存入到文件中(有三列,分别是chrom,start,end,分隔符是Tab),若文件后缀是tsv,则。

2025-06-03 21:01:23 31

转载 科研中的野马效应:当情绪失控比失败更致命

在心理学寓言中,“野马效应”源自一个令人深思的故事:一匹野马被蝙蝠咬伤,虽然伤口本身并不致命,但野马因剧烈疼痛而狂奔、躁动,最终死于自身失控的情绪与反应,而非蝙蝠本身。项目评审“一票否决”,论文审稿“动辄打击”,申请岗位“唯刊论人”,加之对“天才成功学”的神化,让无数科研青年在每一个小挫折面前如履薄冰。当制度只关心产出而忽略人的心理承载力,当导师只看结果而忽略过程中的挣扎,当同侪竞争变得不允许坦诚与脆弱,科研人自然会变成“被蝙蝠咬后的野马”——不是被失败压垮,而是被不被允许失败的文化击溃。

2025-06-02 00:01:49 29

转载 本地生源比例最高的985大学一览,一起来看看哪所985大学本地人最多!

当然,同样本地生源在25%以上的985大学还有山东大学的35%,四川大学的29%,厦门大学的28%,中国海洋大学的27%,以及差一点点达到这个比例的兰州大学,我们也不难发现这些高校其实在各自省内也只有1座985大学, 而拥有2座985大学的山东省,其两所上榜高校也在25%-35%这个本地生源的区间之内,且山东的高考报名人数也接近百万人次!这个比例其实能够反映很多的信息,为何这所985本地生源较高,甚至能够反映出一座省份的整体的一个高等教育的水准,那么究竟我国的各所985高校,其本地生源的占比都达到多少呢?

2025-06-01 21:01:23 725

转载 文献速递 | Nature文章目录 2025.5.1

The United States President’s Emergency Plan for AIDS Relief, 美国总统防治艾滋病紧急救援计划)是美国政府投入超过1000亿美元用于抗击艾滋病病毒/艾滋病感染的计划,已拯救了2500多万人生命,防止了2500万亿艾滋病感染,加速了在50多个国家上抗制艾滋病的进展。,产生优秀后代的学科。它的措施涉及各种影响婚姻和生育的社会因素,如宗教法律、经济政策、道德观念、婚姻制度等。图2: 根据非洲、近东和南欧的现代个体以及这些个体的地理位置计算的PCA图。

2025-05-30 21:02:43 295

转载 第十四届全国生物信息学与系统生物学学术大会(第一轮通知)

本次大会将围绕生物信息学与系统生物学的最新研究进展和热点问题,设置大会报告、分会场报告、专题论坛、墙报展示等多种形式的学术交流活动。会议将邀请生物信息学各个前沿方向的国内外杰出专家学者、和大会投稿评选出的学者作大会报告、分论坛报告,分享他们在该领域的最新研究成果和前沿动态。陈炜、胡政、焦雨铃、李霞、刘锐、卢培龙、倪俊、邱强、沈百荣、宋述慧、汤富酬 、王怡宁、徐辰武、杨雪瑞、张家军、赵方庆、郑明月、邹权。第十四届全国生物信息学与系统生物学学术大会将于。陈润生、乔 杰、张泽民、王振常、张宏家、黄 昆、张强锋。

2025-05-28 21:01:45 95

转载 新课第四期 | 单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源

代码,记录了分析的过程和细节,存档在计算机中,便于使用、回顾、审查、优化、发表和共享。世代周期短,进化/演化迅速。对于其它物种,如大型动/植物基因组 (尤其是跨物种),则不适用此课程,原因包括:实施难度 (动/植物基因组的组装难度更大),分析模块 (动/植物无需做传播与溯源分析)及中间数据 (本课程主要利用核心基因组构树,而非同源基因)等。本课程的技术与理论体系,也有助于微生物实验室/课题组:建立系统的基因组分析流程,完善质量管理体系,培养相关生信人才,提示软件、流程及数据库的开发方向和评估方法。

2025-05-28 21:01:45 41

转载 道地药材评价理论的传承与创新:三优

值此《中国中药杂志》创刊七十周年之际,应编辑部特约撰稿,中国中医科学院袁媛研究员与黄璐琦院士系统回顾了道地药材理论的发展脉络,并引入生物力学与细胞发育理论,提出道地药材生物力学研究的新视角,以深化道地药材“三优”理论。 道地药材评价理论的发展对于保障临床药效的稳定性、传承和发展中医药事业具有深远的意义。道地药材评价理论的萌芽可追溯至东汉时期,历经千年的传承和认知体系的迭代,已从基于传统物象观的“辩状论质”理论逐渐演进为现代科学量化评价导向的道地药材“三优”理论,这一转变充分体现了传统智慧与现代科技的融

2025-05-28 21:01:45 54

转载 ICP | 中国中医科学院黄璐琦院士和袁媛研究员联合湖北医药学院李琛教授揭示粉葛来源大豆苷促进根膨大的分子机制

通过重塑生长素极性运输、调控干细胞稳态核心蛋白网络和细胞周期蛋白,协调根膨大的分子机制,为药材品质形成机制研究和品种选育提供新策略。大豆苷对生长素极性运输的重构尽管破坏了其从地上部向根尖的运输,但促进了局部生长素浓度的升高,最终触发根尖膨大与根毛密度增加。以拟南芥根系平台为模型,对葛根素、大豆苷和大豆苷元的根调控作用进行了验证。)在侧根韧皮部特异性富集的空间分布规律,而其苷元大豆苷元(过表达株系中,大豆苷抑制主根伸长的活性减弱(图。报告系统,揭示大豆苷改变了生长素的极性运输。

2025-05-27 21:04:00 99

转载 经典入门 | 高级转录组分析和R数据可视化 (2025.9)

线上线下**同步开课,将系统讲述基于和不基于比对的转录组分析流程,从原始数据到表达矩阵、差异基因、转录组拼装、可变剪接、非编码RNA、ceRNA、转录因子调控网络、富集分析、加权共表达网络、通路分析、可视化绘图、机器学习等一系列常见操作,理论和实践兼备,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个转录组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创四段式教学(2天集中授课+自行练习+讨论群讲解答疑+上课视频回看反复练习),“教—练—答—用”四个环节统一协调,真正实现独立分析大数据。

2025-05-27 21:04:00 133

转载 Cell | 肠道微生物定植的保守遗传基础

研究论文● 期刊:Cell (IF:45.5)● DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.03.010● 原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00283-1● 第一作者:Menghan Liu● 通讯作者:Saeed Tavazoie(st2744@columbia.edu)● 发表日期:2025-4-4● 主要单位:哥伦比亚大学、洛克菲勒大学、西奈山伊坎医学院摘要Abstract尽管肠道微生物十

2025-05-25 21:00:41 63

转载 J. Pharm. Anal│中国中医科学院中药研究所杨滨研究员团队提出中药活性体内代谢产物检测新策略

2)表征的中药体内代谢产物谱扩大,不仅表征了大多数文献关注的中药成分原型化合物和原型化合物直接衍生的代谢物,还表征了中药成分的体内异构化代谢物、降解产物以及其衍生代谢物。3)增加了代谢产物的溯源分析用以阐明代谢物间的网络关系,特别是区分异构体原型衍生的代谢物、以及区分中药成分原型化合物及其他成分衍生的I相代谢产物。受体的分子互作分析,发现了17种潜在的活性代谢物,包括3种原型成分的氧化代谢物,2种降解产物的还原代谢物,5种原型成分的异构化代谢物,及其他原型化合物或母体成分;点击图片直达文字对应教程。

2025-05-24 21:01:03 44

转载 iMeta | 王春莉/董念国/王贵学/许康 解析肠道菌群影响脉瓣膜钙化的创新机制

点击蓝字 关注我们肠道微生物群来源的丁酸通过调节GAPDH乳酸化和丁酰化进而抑制钙化性主动脉瓣疾病进程iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70048● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70048● 2025年5月19日,湖北中医药大学许康、王春莉联合重庆大学王贵学、武汉协和医院董念国

2025-05-24 21:01:03 51

转载 微生物组-扩增子16S分析和可视化(2025.11)

本课程一共3天,每天6节课,共18节课,全部课程均理论与实战结合(只要课上讲的内容,都是要带你亲自实现的分析)。这个时代早已成为历史。易生信团队组织宏基因组、生信宝典的一线生信专家,为广大生物学家,定制了一套安装部署简单、鼠标点击编程、支持主流操作系统、学习成本低、又灵活的扩增子分析流程,助力生物学家轻松分析数据,更专注生物学现象的挖掘。但这些只是入门,在培训上,我们将结合发表高水平文章,进一步讲解16种常用分析图型结果的原理和使用范围,让您不仅读懂图,更知道如何应用于自己的研究,并亲自轻松完成绘图。

2025-05-22 21:02:17 108

转载 分子生药学30周年发展研讨会暨第十三届暑期活动周(第一轮通知)

日,中国中医科学院医学实验中心、中药资源中心、研究生院将联合举办分子生药学30周年发展研讨会暨第十三届分子生药学暑期活动周,总结在分子生药学学科体系与队伍建设、教育教学与人才培养、科学研究与社会服务等方面取得的成果。为深入推进分子生药学教学质量,提高教师队伍的教学能力,推动分子生药学课程建设与发展,特以《分子生药学》“十四五”规划教材为基础,参加者自选该教材目录中的任一章节进行20分钟教学示范与说课,专家点评5分钟。2. 说课(20分钟):介绍教学目标、内容分析、教学方法、教学手段、教学特色和教学反思。

2025-05-22 21:02:17 70

转载 iMeta | 中国农大曹志军组-解析奶业系统中奶牛-犊牛胃肠道抗性组的传播

shiyan点击蓝字 关注我们奶牛“母子”模型中胃肠道抗性组的时空特征及其在奶业生产系统中的环境传播iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70047● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70047● 2025年5月14日,中国农业大学曹志军课题组在iMeta在线发表了题为“Spatio-

2025-05-22 21:02:17 175

转载 iMeta | 浙大王永成/沈一飞-微生物组单细菌RNA测序深度解析人类肠道菌群的动态代谢功能特征

点击蓝字 关注我们微生物组单细菌RNA测序揭示人类肠道关键菌种未被探索的特化代谢功能iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imt2.70035● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70035● 2025年4月17日,浙江大学王永成/沈一飞等在iMeta在线发表了题为“Single-mic

2025-05-20 21:00:45 255

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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